Часто люди через незнання збирають на природі не ромашку аптечну, а інші рослини, що мають схожі суцвіття. Найбільшу схожість з цілющою ромашкою мають триреберник непахучий і собача ромашка (роман собачий), що часто зустрічаються. Відрізнити ромашку аптечну від її двійників можна за двома ознаками.
По-перше, за запахом. Суцвіття аптечної ромашки мають сильно виражений, дуже приємний, схожий на яблучний аромат. Двійники або взагалі не пахнуть, або, як у випадку романа собачого, мають неприємний запах. Другу відмінність можна знайти, якщо розрізати суцвіття вздовж. У ромашки аптечної квітоложе (серединка) має напівкулясту або конічну форму, а всередині нього – порожнина. У схожих видів цієї порожнини немає.